Langsung ke konten utama

Second Generation Sequencing untuk Urutkan DNA Manusia Purba dari Sampel Manusia Modern

loading...
bisnis online
(KeSimpulan) DNA dari sisa-sisa tanaman yang lama mati, hewan, atau manusia memungkinkan secara langsung untuk melihat ke dalam sejarah evolusi. Sejauh ini, penelitian semacam ini pada nenek moyang anggota spesies manusia telah terkendala karena ketidakmampuan para ilmuwan untuk membedakan DNA purba asli dan DNA yang telah terkontaminasi dengan manusia modern. Sekarang, penelitian oleh Svante Pääbo dari The Max-Planck Institute for Evolutionary Anthropology di Leipzig yang diterbitkan pada 31 Desember di Current Biology - Cell berusaha mengatasi kendala ini dan menunjukkan kemungkinan secara langsung analisisi DNA spesies manusia yang hidup sekitar 30.000 tahun yang lalu.

DNA sebagai materi herediter yang terdapat dalam inti dan mitokondria dari semua sel-sel tubuh adalah molekul kuat dan dapat bertahan, kondisi yang memungkinkan selama beberapa puluhan ribu tahun. Seperti DNA purba, para ilmuwan memberikan kemungkinan unik untuk langsung melihat ke make-up genetik dari organisme yang telah lama menghilang dari Bumi. Menggunakan DNA purba yang diekstrak dari tulang, biologi hewan purbakala, mammoths, serta manusia purba seperti Neanderthal telah dipelajari dalam beberapa tahun terakhir.

Pendekatan DNA purba tidak dapat dengan mudah diterapkan pada anggota spesies manusia purba. Hal ini karena fragmen-fragmen DNA dikalikan dengan molekul khusus yang menargetkan DNA sequences tertentu. Probe ini bagaimanapun tidak dapat membedakan apakah DNA berasal dari sampel manusia purba atau yang muncul pada kemudian hari, misalnya para arkeolog yang menangani tulang. Jadi, kesimpulan tentang genetik make-up spesies manusia purba menjadi penuh ketidakpastian.

Dengan menggunakan sisa-sisa manusia yang hidup di Rusia sekitar 30.000 tahun yang lalu, Pääbo dan rekan-rekannya memanfaatkan teknik sekuensing DNA terbaru (misalnya, membaca urutan basa yang membentuk untaian DNA) untuk mengatasi masalah ini. Teknik-teknik ini, dikenal sebagai "second-generation sequencing," memungkinkan para peneliti untuk "membaca" secara langsung dari molekul DNA purba, tanpa harus menggunakan probe untuk menggandakan DNA. Selain itu, mereka dapat membaca urutan fragmen sangat pendek, ciri khas DNA purba dari waktu ke waktu secara tetap karena untaian DNA cenderung putus.

Sebaliknya, DNA yang lebih muda dan hanya muncul pada manusia modern masuk dalam kontak sampel dengan terdiri dari banyak lagi fragmen. Fitur lainnya, seperti yang ditimbulkan oleh kerusakan kimia purba dibandingkan dengan DNA modern, secara efektif memungkinkan para peneliti untuk membedakan antara molekul DNA purba asli dan DNA kontaminasi modern. "Kami sekarang dapat melakukan apa yang tidak mungkin kami lakukan pada setahun lalu, menentukan sekuens DNA manusia purba dari DNA manusia modern, tetapi ini masih sangat mungkin hanya dari spesimen yang terpelihara baik," kata Pääbo.

Penerapan teknologi sisa-sisa anggota spesies manusia yang hidup pada puluhan ribu tahun yang lalu membuka kemungkinan untuk menjawab berbagai hipotesis tentang evolusi dan prasejarah spesies manusia yang tidak mungkin dijawab dengan metode sebelumnya, misalnya apakah manusia yang tinggal di Eropa pada 30.000 tahun yang lalu adalah nenek moyang langsung orang Eropa pada saat ini atau apakah mereka kemudian digantikan oleh imigran yang membawa teknologi baru seperti pertanian.

Para peneliti adalah Svante Pääbo, Johannes Krause, Adrian Briggs, Matrin Kircher, Tomislav Maricic, dan Nicolas Zwyns dari Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Leipzig, Jerman; Anatolii Derevianko dari Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Rusia.
bisnis online
Ikuti sains dan teknologi terkini di: Laporan Penelitian. Update via: Google+ Twitter Facebook Pinterest YouTube
Kesimpulan.com menerima konten tentang teknologi, sains, lingkungan dan bisnis dari siapa saja. Kami siap untuk publikasi dan press release. Informasi lanjut kunjungi laman ini.

Komentar