Teknik Genomika Retroposon Lacak Migrasi Evolusi Marsupialia

Tinuku
(KeSimpulan) Kanguru, oposum, dan Tasmanian devils mungkin berbeda secara dramatis dalam fitur dan lokasi, tetapi mereka berbagi pohon keluarga yang sama. Para peneliti menganalisis selama bertahun-tahun tentang bagaimana marsupial (atau marsupialia) berkembang dan menyebar ke seluruh dunia. Sekarang sebuah studi baru akhirnya melihat "lompatan" gen memecahkan misteri ini.

Lebih dari 300 spesies marsupial hidup di benua Amerika dan Australia. Makhluk-makhluk yang terkenal karena kantong pembawa bayi di mana tetap mengasuh dan memberi makan bayinya. Mereka adalah kerabat terdekat placental mammals (seperti manusia) tetapi berpisah membentuk kelompok sendiri pada 130.000.000 tahun yang lalu. Mereka menetap terutama di Amerika Selatan dan Australia yang pada saat itu bagian dari supercontintent dikenal sebagai Gondwana.

Sekuensing DNA dan catatan fosil mengirim dua cerita yang berbeda tentang bagaimana penyelesaian datang. DNA menunjukkan bahwa nenek moyang tunggal di Amerika Selatan menyebar ke Australia sebelum benua terpisah dan marsupial pada setiap benua kemudian berkembang sendiri. Namun fosil menunjukkan deskripsi yang lebih rumit di mana beberapa nenek moyang melakukan perjalanan kembali ke Amerika Selatan, artinya beberapa spesies Amerika Selatan kemungkinan muncul pertama kali di Australia.

Di tengah konflik ini, Monito del Monte atau "little mountain monkey." Marsupial langka dan kecil ini hanya di hutan hujan di Andes selatan di Chile dan Argentina, tetapi memiliki kelas dengan saudaranya di Australia berdasarkan kesamaan antara pergelangan kaki dan tulang telinga serta beberapa marsupial Australia yang telah punah. Beberapa peneliti merujuk Monito sebagai bukti migrasi yang lebih kompleks, tetapi peneliti yang lain tetap tidak yakin karena data DNA tidak meyakinkan.

Untuk memilah, Maria Nilsson, biolog evolusi dari University of M√ľnster di Jerman dan rekannya mulai mencari bit aneh DNA yang disebut retroposons. Retroposon putus dari DNA kromosom dan copy-paste diri kembali di tempat lain dalam genome. Tidak seperti kode genetik (yang tunduk pada mutasi acak dan peristiwa lain yang membuat analisis sulit), retroposons dan lokasi mereka dapat diprediksi dan stabil setelah copy dan paste. Hal ini lebih dapat diandalkan sebagai penanda untuk menentukan hubungan di antara binatang tersebut, jika dua spesies memiliki retroposons sama di tempat yang sama, mereka mungkin memiliki nenek moyang yang sama.

Nilsson membandingkan formasi retroposon opossum Amerika Selatan, tammar wallaby Australia, dan 20 spesies lainnya, termasuk wombat, wallaroo, dan mole berkantung. Semua marsupial berbagi 10 retroposon yang sama, menegaskan bahwa mereka semua berbagi nenek moyang. Marsupial Amerika Selatan telah mengalami sedikit insiden copy-dan-paste retroposon yang menunjukkan bahwa mereka membentuk cabang-cabang pohon yang lebih tua.

Opossum secara universal tidak memiliki dua retroposon menunjukkan bahwa mereka adalah terdekat di mana genetik berbicara tentang nenek moyang berkantung. Bahkan tempat Monito yang misterius ditemukan andil fitur genetik tertentu dengan marsupial Australia, tetapi sudah pasti lebih dekat dengan sesamanya di Amerika Selatan. Data retroposon juga jelas membagi marsupial Australia dan Amerika Selatan ke dalam kelompok-kelompok pentunjuk berbeda dari binatang yang mengalami sedikit kontak saat mereka berevolusi.

Secara bersama hasil menunjukkan bahwa migrasi tunggal dari Amerika Selatan ke Australia memunculkan berbagai variasi yang dapat dilihat pada hari ini, termasuk Monito. "Saya sangat senang. Saya rasa ini akan memecahkan kontroversi," kata Nilsson.

Temuan yang dilaporkan di PLoS Biology merupakan "langkah maju yang sangat besar dalam pemahaman hubungan berkantung," kata Matius Phillips, biolog evolusi dari Australian National University di Canberra.

Satu-satunya kekurangan dari teknik retroposon tidak dapat menjelaskan kematian, kepunahan marsupial yang pernah mengisi pohon keluarga. Menggabungkan teknik retroposon dengan data fosil dapat membantu para peneliti mendapatkan gambaran yang lebih rinci tentang di mana dan bagaimana nenek moyang berkantung bermigrasi. "Penelitian ini menyediakan teknik yang berguna dan pondasi untuk studi masa depan" yang akhirnya dapat meletakkan menjawab kontroversi, kata Phillips.
  1. Nilsson MA, Churakov G, Sommer M, Tran NV, Zemann A, et al. (2010) Tracking Marsupial Evolution Using Archaic Genomic Retroposon Insertions. PLoS Biol 8(7): e1000436. doi:10.1371/journal.pbio.1000436
Tinuku Store

No comments:

Post a Comment