Daphnia pulex Organisme Kecil Dengan Sekuens Genome Besar dan Unik

Tinuku
News KeSimpulan.com - Organisme kecil dengan sekuens genome besar. Tim peneliti telah melakukan sekuensing genome kutu air kecil mendekati mikroskopis Daphnia pulex.

Ketika anda menyelam ke danau, Anda akan menelan ratusan Daphnia pulex, kutu air bermata satu penghisap ganggang. Makhluk itu telah lama memikat para biolog karena kemampuannya untuk berpindah-pindah kehidupan dari cara-cara aseksual dan seksual serta dapat bertahan selama beberapa dekade di dasar danau membeku. Selain itu Daphnia pulex memiliki sensitivitas tinggi terhadap bahan kimia beracun yang membantu para ekolog memantau kualitas air di kolam dan danau.

Sekarang tim penelitian besar memberi kesempatan kepada para peneliti untuk mengetahui mekanisme kutu air ini berkat genome yang baru saja disekuensing, dan dilaporkan ke Science :

We describe the draft genome of the microcrustacean Daphnia pulex, which is only 200 megabases and contains at least 30,907 genes. The high gene count is a consequence of an elevated rate of gene duplication resulting in tandem gene clusters. More than a third of Daphnia’s genes have no detectable homologs in any other available proteome, and the most amplified gene families are specific to the Daphnia lineage.

The coexpansion of gene families interacting within metabolic pathways suggests that the maintenance of duplicated genes is not random, and the analysis of gene expression under different environmental conditions reveals that numerous paralogs acquire divergent expression patterns soon after duplication.

Daphnia-specific genes, including many additional loci within sequenced regions that are otherwise devoid of annotations, are the most responsive genes to ecological challenges.

Sepertiga dari hampir 31.000 gen yang unik dan tampaknya untuk merespon predasi, paparan toksin, dan bakteri. Genomika ini telah merangsang para genetikawan dan ekolog mendapat kesempatan untuk memahami gen yang bertanggung jawab untuk beberapa bakat aneh binatang tersebut seperti tumbuhnya duri ekor pelindung, helm, dan gigi leher dalam merespon bahan kimia yang diproduksi oleh predator.

Ketika Anda meneguk sejumlah air danau atau kolam renang, Anda dapat akan mendapatkan kepuasan karena tidak hanya menelan crustacea berlapis baja tetapi organisme yang memiliki genome menakjubkan.

John K. Colbourne, et.al. The Ecoresponsive Genome of Daphnia pulex, Science, 4 February 2011: Vol.331 no.6017 pp.555-561 DOI:10.1126/science.1197761

Credit : Science
Tinuku Store

No comments:

Post a Comment